MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia parkeri str. Portsmouth chromosome

Total Repeats: 8190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017044	TAAT	2	8	44	51	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017044	CCAA	2	8	69	76	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017044	TTA	2	6	156	161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017044	TA	3	6	180	185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017044	ATA	2	6	2730	2735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017044	AT	3	6	2737	2742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017044	TTA	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017044	TGT	2	6	2751	2756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017044	CAA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017044	ATT	3	9	2849	2857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017044	T	6	6	2931	2936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017044	TATT	2	8	2977	2984	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017044	TAA	2	6	3015	3020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017044	ATA	2	6	3059	3064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017044	TTA	2	6	3067	3072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017044	A	6	6	3072	3077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017044	ATT	2	6	3936	3941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017044	TTTA	2	8	3969	3976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017044	TGT	2	6	3987	3992	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017044	TTG	2	6	4042	4047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017044	ATTT	2	8	4462	4469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017044	GTT	2	6	9122	9127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017044	T	7	7	9388	9394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017044	TCC	2	6	9666	9671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017044	TAAA	2	8	9714	9721	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017044	TCT	2	6	10974	10979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017044	AAT	2	6	11017	11022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017044	T	7	7	11071	11077	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017044	GCT	2	6	11099	11104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017044	GAC	2	6	11111	11116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017044	CAA	3	9	11130	11138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017044	TA	3	6	12231	12236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017044	TAT	2	6	12248	12253	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017044	CAA	2	6	12255	12260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017044	ATG	2	6	12299	12304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017044	AGC	2	6	12316	12321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017044	ATA	2	6	12348	12353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017044	TTC	2	6	12392	12397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017044	CAA	2	6	12423	12428	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017044	A	7	7	12454	12460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017044	AAG	2	6	12498	12503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017044	AATTA	2	10	12504	12513	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017044	AT	3	6	12514	12519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017044	T	6	6	12528	12533	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017044	T	6	6	12552	12557	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017044	GTA	2	6	12576	12581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017044	TTA	2	6	12607	12612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017044	TTAA	2	8	12621	12628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017044	GTG	2	6	12706	12711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017044	TA	3	6	12784	12789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017044	TCG	2	6	12814	12819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017044	CGCTC	2	10	12856	12865	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_017044	TTA	2	6	12926	12931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017044	TTC	2	6	13083	13088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017044	AGA	2	6	13135	13140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017044	A	8	8	13226	13233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017044	TGA	2	6	13247	13252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017044	CAA	2	6	13255	13260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017044	GCT	2	6	13308	13313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017044	ATGA	2	8	13317	13324	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017044	AGT	2	6	13375	13380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017044	AGC	2	6	13416	13421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017044	GAT	2	6	13496	13501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017044	GAT	2	6	13555	13560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017044	AAG	2	6	13692	13697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017044	TAT	2	6	13723	13728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017044	GAA	2	6	13796	13801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017044	A	6	6	13800	13805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017044	GAA	2	6	13809	13814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017044	AGCAG	2	10	13832	13841	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017044	ATT	2	6	13879	13884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017044	TAG	2	6	13934	13939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017044	CAG	2	6	13954	13959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017044	TTAAT	2	10	13975	13984	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017044	ATT	2	6	14083	14088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017044	T	6	6	14087	14092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017044	A	7	7	14171	14177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017044	AAT	2	6	14204	14209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017044	TAG	2	6	14229	14234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017044	AGAAAA	2	12	14299	14310	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017044	TCT	2	6	14311	14316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017044	A	7	7	14317	14323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017044	TAAA	2	8	14352	14359	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017044	TAGCTC	2	12	14362	14373	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017044	TA	3	6	14381	14386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017044	CAA	2	6	14387	14392	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017044	CTT	2	6	14457	14462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017044	GAA	2	6	14474	14479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017044	T	7	7	14482	14488	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017044	TAAA	2	8	14517	14524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017044	TCAT	2	8	14561	14568	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_017044	CTT	2	6	14613	14618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017044	GAT	2	6	14628	14633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017044	CTTT	2	8	14695	14702	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017044	GAT	2	6	14876	14881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017044	TTA	2	6	14922	14927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017044	TTAG	2	8	14940	14947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017044	TAA	2	6	14952	14957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017044	GTT	2	6	14973	14978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017044	GCTT	2	8	16517	16524	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017044	TTG	2	6	18070	18075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017044	TG	3	6	18074	18079	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017044	A	6	6	18135	18140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017044	T	7	7	18156	18162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017044	ATT	2	6	18163	18168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017044	CA	3	6	18220	18225	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017044	AGAACA	2	12	18249	18260	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017044	T	9	9	18321	18329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017044	TTA	2	6	18338	18343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017044	TTA	2	6	18348	18353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017044	TTA	2	6	18422	18427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017044	T	6	6	18435	18440	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017044	A	6	6	18455	18460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017044	TAT	2	6	18461	18466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017044	A	6	6	18705	18710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017044	A	6	6	18718	18723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017044	TAA	2	6	19394	19399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017044	GTA	2	6	19407	19412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017044	ATC	2	6	19422	19427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017044	AGAT	2	8	19436	19443	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017044	ATT	2	6	19498	19503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017044	TA	3	6	19790	19795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017044	T	6	6	19796	19801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017044	T	6	6	19841	19846	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017044	TAA	2	6	19863	19868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017044	AGTA	2	8	20015	20022	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017044	AT	3	6	20033	20038	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017044	AAAC	2	8	20065	20072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_017044	A	6	6	20075	20080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017044	A	7	7	20083	20089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017044	TTG	2	6	20090	20095	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017044	AAT	2	6	20130	20135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017044	TAAA	2	8	20140	20147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017044	ATT	2	6	20172	20177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017044	AAT	2	6	20267	20272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017044	TA	3	6	20317	20322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017044	TTAT	2	8	20338	20345	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017044	TTTAA	2	10	20375	20384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017044	TA	3	6	26166	26171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017044	ACTA	2	8	26216	26223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_017044	ACC	2	6	26270	26275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_017044	TATAA	2	10	26333	26342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017044	AAT	2	6	26350	26355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017044	CAC	2	6	26369	26374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_017044	TAC	2	6	26586	26591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_017044	AAC	2	6	26925	26930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_017044	TTAT	2	8	26931	26938	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017044	TAA	2	6	26976	26981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017044	TTA	2	6	26995	27000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017044	AT	3	6	27019	27024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017044	CTT	2	6	27054	27059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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157	NC_017044	TAA	2	6	27332	27337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017044	TAA	2	6	27353	27358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017044	A	7	7	27357	27363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_017044	AAGT	2	8	27458	27465	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_017044	A	6	6	28854	28859	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_017044	A	6	6	28925	28930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017044	TAAA	2	8	28946	28953	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017044	AT	4	8	28954	28961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017044	GATA	2	8	29034	29041	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017044	A	6	6	30544	30549	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_017044	ATG	2	6	45195	45200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_017044	TAAT	2	8	45287	45294	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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